Tutorial da comunidade brasileira de Drupal com o passo-a-passo da atualização de forma correta e segura.
Isso é muito importante uma vez que, as novas versões dos módulos dependem de versões recentes do Drupal.

http://drupal-br.org/suporte/drupal/passo-passo-de-como-atualizar-drupal-6x-para-uma-versao-mais-recente